Variabilidad genetica y evolucion del viroide del mosaico latente del melocotonero

• Autores: Silvia Ambrós Palaguerri
• Directores de la Tesis: Ricardo Flores Pedauye (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat de València ( España ) en 1999
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Esteban Domingo Solans (presid.), Pedro Miguel Carrasco Sorlí (secret.), Pedro Moreno Gómez (voc.), Andrés Moya Simarro (voc.), Fernando García Arenal (voc.)
• Materias:
  • Química
    • Bioquímica
      • Biología molecular
  • Ciencias de la vida
    • Biología molecular
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• Resumen

  • El sistema formado por el PLMVd y el melocotonero de semilla GF-305 se ha utilizado como modelo para el estudio de las interacciones entre un viroide que contiene ribozimas de cabeza de martillo y su huésped natural. La caracterización molecular de un conjunto de 29 variantes de secuencia procedentes de tres aislados del PLMVd que difieren en su patogenicidad, un aislado agresivo, el D168 y dos aislados latentes, el Esc76906 y el LS35, mostró un gran polimorfismo de secuencia en la molécula viroidal. El patrón de variabilidad observado indica que la heterogeneidad de secuencia en el PLMVd se encuentra limitada al menos por tres tipos de restricciones estructura-función: la formación de unas ribozimas de cabeza de martillo estables, la conservación de una conformación global ramificada de la molécula y el mantenimiento de una interacción potencial de tipo pseudonudo entre dos bucles de la estructura secundaria propuesta para este viroide.

    Los análisis filogenéticos llevados a cabo con las 29 nuevas variantes del PLMVd han permitido establecer tres grandes grupos de secuencia, cada uno de los cuales se caracteriza por un patrón de variabilidad distinto. Los resultados de los bioensayos sobre GF-305 de variantes individuales del PLMVd pertenecientes a los tres aislados seleccionados han mostrado que las propiedades biológicas de los mismos deben ser consecuencia de la complejidad de sus poblaciones y de la presencia en ellas de determinadas variantes moleculares.

    Se ha caracterizado biológica y molecularmente una variante del PLMVd que contiene una sustitución U4 C en el bolsillo catalítico de la ribozima de cabeza de martillo de polaridad positiva. El RNA viroidal mutante, pero no aquellos con las otras dos sustituciones posibles en el bolsillo catalítico, U A y U G, mostró un autocorte significativo durante la transcripción in vitro. Además, el cDNA de longitud completa correspondiente a esta variante de s