El conotruncus es el segmento más distal del tubo cardiaco primitivo, intercalándose entre el bulbo, futuro ventrículo derecho y la aorta ventral primitiva. El conu sse encuentra inicialmente a la derecha del infundíbulo pulmonar, mientras que a la izquierda se produce la regresión completa de su porción subaórtica.
La unión conotroncular y el truncus dan origen a los orificios y las válvula semilunares, la aorta ventral primitiva, la aorta descendente y el tronco de la arteria pulmonar.
No existe todavía unanimidad en cuanto a las modalidades de su morfogénesis y, en consecuencia, sobre el posible mecanismo de las cardiopatía secundarias a su patología.
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