Actualmente el Programa Editorial del Instituto de Biología consta de diferentes tipos de publicaciones, todas ellas relacionadas con su misión, que es el desarrollo de investigación científica sobre el origen y el mantenimiento, las interacciones, la distribución, la composición actual, el aprovechamiento y la conservación de diversidad biológica, así como difundir el conocimiento entre la sociedad mexicana, con el propósito de contribuir a la comprensión y conservación de la biodiversidad.

Las Publicaciones Especiales del IB incluyen principalmente libros científicos, aunque también se publican listados, manuales, cuadernos y materiales de divulgación.

Entre los materiales diversos cabe destacar los ya tradicionales Calendarios del Instituto de Biología, en forma de cartel, que ilustran parte de la gran biodiversidad que tiene nuestro país y que año con año son esperados por un importante público.

La Flora Mesoamericana publicada en conjunto con el Missouri Botanical Garden y el Museo de Historia Natural de Londres, y la Flora del Valle de Tehuacán-Cuicatlánson dos series emblemáticas del IB.

La publicación periódica del IB es la Revista Mexicana de Biodiversidad (antes Anales del Instituto de Biología de la Universidad Nacional Autónoma de México). Esta revista publica trabajos nacionales o extranjeros, resultado de investigaciones científicas originales, en español o inglés, sobre el conocimiento de la biodiversidad (sistemática, biogeografía, ecología y evolución), su conservación, manejo y aprovechamiento.